Consortium autour de l’HOlobionte des agroécosystèmes Polyculture-Elevage TROPicaux – HOPETROP

Objectifs

Le projet HopeTrop, centré sur la compréhension du rôle des microbiotes dans les performances agroécologiques des systèmes polyculture-élevage tropicaux aux Antilles, vise à constituer un consortium interdisciplinaire mobilisant des expertises en microbiotes animal, végétal et sol, ainsi qu’en bio-informatique et biostatistique. Les actions envisagées incluent notamment l’organisation de webinaires bimestriels d’acculturations croisées, une formation hybride en bio-informatique/biostatistique, et la co-construction d’un protocole expérimental. Le projet s’appuiera sur la caractérisation des pratiques et de la multiperformance d’exploitations bio de Guadeloupe réalisées en 2024-2025. Le consortium se donne pour mission de concevoir collectivement dans une logique de construction progressive, un dispositif expérimental en ferme capable d’identifier des « points chauds » de flux microbiens fonctionnels, entre compartiments sol-plante-animal sur un nombre restreint d’échantillons au sein de l’exploitation. Les données seront collectées et analysées dans le cadre d’un stage coencadré et grâce à la montée en compétence collective. Un séminaire en fin de projet formalisera l’avancée des travaux dans un papier de preuve de concept puis, réfléchira à un dispositif expérimental pour analyser l’effet des pratiques agricoles telle que l’intégration culture-élevage (via les flux de biomasse entre compartiments) sur l’holobionte.

Coordinateurs 
 Nathalie MANDONNET, UR ASSET
 A.MEYNADIER, UMR GenPhyse

Financeur
MétaProgramme INRAE Holoflux ici

Partenaires:

• UR ASSET : Audrey FANCHONE, Ellen LACLEF, Jean-Luc GOURDINE, Maguy EUGENE, Nausicaa POULLET, Jean-Christophe BAMBOU
• UE PTEA : Nathalie MINATCHY
• UE PEYI : David HAMMOUYA
• ECOTERCA UA : Fatoumata FALL
• UMR GABI :  Jordi ESTELLE
•  UMRH : Diego MORGAVI 
•  UMR GenPhyse : Géraldine PASCAL 
• UMR Agroécologie de Institut Agro Dijon : Sophie SADET-BOURGETEAU et Nicolas CHEMIDLIN-PREVOST-BOURE

• ECOTERCA UA : ÉCOlogie TERrestre CAribéenne ici ; UA : Université des Antilles ici
• UE PEYI : Plateforme Expérimentale sur le végétal et les agrosYstèmes Innovants
• UE PTEA : Unité Expérimentale Plateforme Tropicale d’Expérimentation sur l’Animal ici
• UMR : Unité Mixte de Recherche Agroécologie ici
• UMR GABI :  Unité Mixte de Recherche Génétique Animale et Biologie Intégrative ici
• UMR GenPhyse : Unité Mixte de Recherche Génétique, Physiologie et Systèmes d'Elevage ici
• UMRH : Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores ici
• UR ASSET : Unité de Recherche Agroécologie, génétique et SystèmeS d’Elevage Tropicaux ici